IDphy

Noggrann identifiering av arter är grundläggande inte bara för sjukdomshantering utan också för genomförandet av reglerande åtgärder för att förhindra patogenspridning. Med tanke på den snabba ökningen av internationell handel är snabba svar baserade på exakt identifiering av patogener avgörande för att skydda jordbruket och naturliga ekosystem från spridningen av förödande sjukdomar. En av de mest utmanande aspekterna av att arbeta med Phytophthora-arter är att identifiera dem korrekt; det kräver omfattande utbildning och erfarenhet. Många diagnostiska laboratorier, både i USA och runt om i världen, saknar denna typ av utbildning och kommer ofta bara att identifiera okända kulturer på släktnivå. Detta kan oavsiktligt tillåta arter av oro att glida igenom oupptäckt. Artkomplex gör molekylär identifiering av arter och implementering av diagnostiska system mycket svårt. Dessutom finns många DNA-sekvenser från felaktigt identifierade Phytophthora-prover tillgängliga i offentliga databaser som NCBI. Att ha sekvenser från typproverna är väsentligt för korrekt molekylär identifiering av arter i släktet.

IDphy utvecklades för att underlätta exakt och effektiv identifiering av arter för släktet, med hjälp av typexemplaren från de ursprungliga beskrivningarna där det är möjligt. IDphy är användbart för forskare runt om i världen, särskilt de som arbetar med diagnostik och regulatoriska program. IDphy betonar arter med hög ekonomisk inverkan och arter av regulatorisk oro för USA.

Författare: Z. Gloria Abad, Treena Burgess, John C. Bienapfl, Amanda J. Redford, Michael Coffey och Leandra Knight

Ursprunglig källa: Den här nyckeln är en del av det kompletta IDPhy-verktyget på https://idtools.org/id/phytophthora (kräver internetanslutning). Externa länkar finns i faktabladen för enkelhets skull, men de kräver också en internetanslutning. Den fullständiga IDphy-webbplatsen innehåller också SOP och strategier för att få en högre nivå av förtroende för molekylär bestämning av okända arter, en tabellnyckel; morfologi och livscykeldiagram samt tillväxt-, lagrings- och sporuleringsprotokoll; och en detaljerad ordlista.

Denna Lucid Mobile-nyckel har utvecklats i samarbete med USDA APHIS Identification Technology Program (USDA-APHIS-ITP). Besök https://idtools.org för att lära dig mer.

Denna app drivs av LucidMobile. Besök https://www.lucidcentral.org för att lära dig mer.

Mobilappen uppdaterad: augusti 2024