IDphy

Natančna identifikacija vrst je bistvena ne le za obvladovanje bolezni, ampak tudi za izvajanje regulativnih ukrepov za preprečevanje širjenja patogenov. Glede na hitro povečanje mednarodne trgovine so hitri odzivi, ki temeljijo na natančni identifikaciji patogenov, ključnega pomena za zaščito kmetijstva in naravnih ekosistemov pred širjenjem uničujočih bolezni. Eden najzahtevnejših vidikov dela z vrstami Phytophthora je njihovo pravilno prepoznavanje; zahteva obsežno usposabljanje in izkušnje. Številni diagnostični laboratoriji, tako v ZDA kot po svetu, nimajo tovrstnega usposabljanja in bodo neznane kulture pogosto identificirali le na ravni rodu. To bi lahko nenamerno omogočilo skrb vzbujajočim vrstam, da zdrsnejo skozi neopažene. Kompleksi vrst zelo otežujejo molekularno identifikacijo vrst in izvajanje diagnostičnih sistemov. Poleg tega so številna zaporedja DNK iz nepravilno identificiranih primerkov Phytophthora na voljo v javnih zbirkah podatkov, kot je NCBI. Za natančno molekularno identifikacijo vrst v rodu je nujno imeti zaporedja iz tipskih osebkov.

IDphy je bil razvit za lažjo natančno in učinkovito identifikacijo vrst za rod z uporabo tipskih primerkov iz izvirnih opisov, kjer je to mogoče. IDphy je uporaben za znanstvenike po vsem svetu, zlasti tiste, ki delajo na področju diagnostike in regulativnih programov. IDphy poudarja vrste z velikim gospodarskim vplivom in vrste, ki so regulativno zaskrbljujoče za ZDA.

Avtorji: Z. Gloria Abad, Treena Burgess, John C. Bienapfl, Amanda J. Redford, Michael Coffey in Leandra Knight

Izvirni vir: Ta ključ je del celotnega orodja IDPhy na https://idtools.org/id/phytophthora (zahteva internetno povezavo). Zunanje povezave so zaradi priročnosti na voljo v informativnih listih, vendar zahtevajo tudi internetno povezavo. Celotno spletno mesto IDphy vključuje tudi SOP in strategije za pridobitev višje stopnje zaupanja v molekularno določitev neznanih vrst, tabelarni ključ; morfologija in diagrami življenjskega cikla ter protokoli rasti, shranjevanja in sporulacije; in podroben glosar.

Ta ključ Lucid Mobile je bil razvit v sodelovanju s programom USDA APHIS Identification Technology (USDA-APHIS-ITP). Za več informacij obiščite https://idtools.org.

To aplikacijo poganja LucidMobile. Za več informacij obiščite https://www.lucidcentral.org.

Posodobljena mobilna aplikacija: avgust 2024