IDphy

Dokładna identyfikacja gatunków ma zasadnicze znaczenie nie tylko dla zarządzania chorobami, ale także dla wdrożenia środków regulacyjnych zapobiegających rozprzestrzenianiu się patogenów. Biorąc pod uwagę szybki wzrost handlu międzynarodowego, szybkie reakcje oparte na dokładnej identyfikacji patogenów mają kluczowe znaczenie dla ochrony rolnictwa i naturalnych ekosystemów przed rozprzestrzenianiem się wyniszczających chorób. Jednym z najtrudniejszych aspektów pracy z gatunkami Phytophthora jest ich prawidłowa identyfikacja; wymaga szerokiego szkolenia i doświadczenia. Wiele laboratoriów diagnostycznych, zarówno w USA, jak i na całym świecie, nie posiada tego rodzaju przeszkolenia i często identyfikuje nieznane kultury jedynie na poziomie rodzaju. Może to spowodować niezamierzone prześlizgnięcie się przez nie niezauważonych gatunków budzących obawy. Kompleksy gatunkowe bardzo utrudniają molekularną identyfikację gatunków i wdrażanie systemów diagnostycznych. Ponadto wiele sekwencji DNA z nieprawidłowo zidentyfikowanych okazów Phytophthora jest dostępnych w publicznych bazach danych, takich jak NCBI. Posiadanie sekwencji z okazów typowych jest niezbędne do dokładnej identyfikacji molekularnej gatunków w rodzaju.

IDphy opracowano w celu ułatwienia dokładnej i skutecznej identyfikacji gatunków w ramach rodzaju, przy użyciu okazów typowych z oryginalnych opisów, tam gdzie to możliwe. IDphy jest przydatny dla naukowców na całym świecie, szczególnie tych pracujących w programach diagnostycznych i regulacyjnych. IDphy kładzie nacisk na gatunki o dużym wpływie gospodarczym i gatunki budzące obawy regulacyjne w USA.

Autorzy: Z. Gloria Abad, Treena Burgess, John C. Bienapfl, Amanda J. Redford, Michael Coffey i Leandra Knight

Oryginalne źródło: ten klucz jest częścią kompletnego narzędzia IDPhy pod adresem https://idtools.org/id/phytophthora (wymaga połączenia z Internetem). Linki zewnętrzne są umieszczone w arkuszach informacyjnych dla wygody, ale wymagają one również połączenia z Internetem. Pełna strona internetowa IDphy zawiera również standardowe procedury operacyjne i strategie mające na celu uzyskanie wyższego poziomu pewności w molekularnym oznaczaniu nieznanych gatunków, klucz tabelaryczny; diagramy morfologii i cyklu życiowego, a także protokoły wzrostu, przechowywania i sporulacji; oraz szczegółowy słowniczek.

Ten klucz Lucid Mobile został opracowany we współpracy z programem technologii identyfikacyjnej USDA APHIS (USDA-APHIS-ITP). Aby dowiedzieć się więcej, odwiedź https://idtools.org.

Ta aplikacja jest obsługiwana przez LucidMobile. Aby dowiedzieć się więcej, odwiedź https://www.lucidcentral.org.

Aktualizacja aplikacji mobilnej: sierpień 2024 r