IDphy

Nøyaktig identifikasjon av arter er grunnleggende ikke bare for sykdomshåndtering, men også for implementering av regulatoriske tiltak for å forhindre spredning av patogener. Gitt den raske økningen i internasjonal handel, er raske reaksjoner basert på nøyaktig patogenidentifikasjon avgjørende for å beskytte landbruket og naturlige økosystemer mot spredning av ødeleggende sykdommer. En av de mest utfordrende aspektene ved å jobbe med Phytophthora-arter er å identifisere dem riktig; det krever omfattende opplæring og erfaring. Mange diagnostiske laboratorier, både i USA og rundt om i verden, mangler denne typen opplæring og vil ofte bare identifisere ukjente kulturer til slektsnivå. Dette kan utilsiktet tillate arter av bekymring å slippe gjennom uoppdaget. Artskomplekser gjør molekylær identifikasjon av arter og implementering av diagnostiske systemer svært vanskelig. Videre er mange DNA-sekvenser fra feil identifiserte Phytophthora-prøver tilgjengelige i offentlige databaser som NCBI. Å ha sekvenser fra typeprøvene er avgjørende for nøyaktig molekylær identifikasjon av arter i slekten.

IDphy ble utviklet for å lette nøyaktig og effektiv identifikasjon av arter for slekten, ved å bruke typeprøvene fra de originale beskrivelsene der det er mulig. IDphy er nyttig for forskere over hele verden, spesielt de som jobber med diagnostikk og reguleringsprogrammer. IDphy legger vekt på arter med høy økonomisk innvirkning og arter av regulatorisk bekymring for U.S.A.

Forfattere: Z. Gloria Abad, Treena Burgess, John C. Bienapfl, Amanda J. Redford, Michael Coffey og Leandra Knight

Originalkilde: Denne nøkkelen er en del av det komplette IDPhy-verktøyet på https://idtools.org/id/phytophthora (krever internettforbindelse). Eksterne lenker er gitt i faktaarkene for enkelhets skyld, men de krever også en internettforbindelse. Den fullstendige IDphy-nettsiden inkluderer også SOP-er og strategier for å oppnå et høyere nivå av tillit til molekylær bestemmelse av ukjente arter, en tabellnøkkel; morfologi og livssyklusdiagrammer samt vekst-, lagrings- og sporuleringsprotokoller; og en detaljert ordliste.

Denne Lucid Mobile-nøkkelen ble utviklet i samarbeid med USDA APHIS Identification Technology Program (USDA-APHIS-ITP). Besøk https://idtools.org for å lære mer.

Denne appen er drevet av LucidMobile. Besøk https://www.lucidcentral.org for å lære mer.

Mobilapp oppdatert: august 2024