IDphy

Precīza sugu noteikšana ir būtiska ne tikai slimību pārvaldībai, bet arī normatīvo pasākumu īstenošanai, lai novērstu patogēnu izplatīšanos. Ņemot vērā starptautiskās tirdzniecības straujo pieaugumu, ātra reakcija, kas balstīta uz precīzu patogēnu identificēšanu, ir ļoti svarīga, lai aizsargātu lauksaimniecību un dabiskās ekosistēmas no postošu slimību izplatīšanās. Viens no grūtākajiem aspektiem darbā ar Phytophthora sugām ir to pareiza identificēšana; tas prasa plašu apmācību un pieredzi. Daudzām diagnostikas laboratorijām gan ASV, gan visā pasaulē trūkst šāda veida apmācības, un tās bieži vien identificē nezināmas kultūras tikai ģints līmenī. Tas var nejauši ļaut sugām, kas rada bažas, izslīdēt cauri neatklātām. Sugu kompleksi ļoti apgrūtina sugu molekulāro identificēšanu un diagnostikas sistēmu ieviešanu. Turklāt daudzas DNS sekvences no nepareizi identificētiem Phytophthora paraugiem ir pieejamas publiskās datubāzēs, piemēram, NCBI. Secības no tipa paraugiem ir būtiskas precīzai ģints sugu molekulārai identificēšanai.

IDphy tika izstrādāts, lai atvieglotu precīzu un efektīvu ģints sugu identifikāciju, kur vien iespējams izmantojot tipa paraugus no oriģinālajiem aprakstiem. IDphy ir noderīga zinātniekiem visā pasaulē, īpaši tiem, kas strādā diagnostikas un regulēšanas programmās. IDphy uzsver sugas ar lielu ekonomisko ietekmi un sugas, kas rada bažas ASV.

Autori: Z. Gloria Abad, Treena Burgess, John C. Bienapfl, Amanda J. Redford, Michael Coffey un Leandra Knight

Sākotnējais avots: šī atslēga ir daļa no pilnīga IDPhy rīka vietnē https://idtools.org/id/phytophthora (nepieciešams interneta savienojums). Ērtības labad faktu lapās ir sniegtas ārējās saites, taču tām ir nepieciešams arī interneta savienojums. Pilnajā IDphy vietnē ir iekļauti arī SOP un stratēģijas, lai iegūtu augstāku ticamības līmeni nezināmu sugu molekulārajā noteikšanā, tabulas atslēga; morfoloģijas un dzīves cikla diagrammas, kā arī augšanas, uzglabāšanas un sporulācijas protokoli; un detalizētu glosāriju.

Šī Lucid Mobile atslēga tika izstrādāta sadarbībā ar USDA APHIS identifikācijas tehnoloģiju programmu (USDA-APHIS-ITP). Lai uzzinātu vairāk, lūdzu, apmeklējiet vietni https://idtools.org.

Šo lietotni nodrošina LucidMobile. Lai uzzinātu vairāk, lūdzu, apmeklējiet vietni https://www.lucidcentral.org.

Mobilā lietotne atjaunināta: 2024. gada augusts