IDphy

Lajien tarkka tunnistaminen on olennaista paitsi taudin hallinnassa, myös taudinaiheuttajien leviämisen estämiseen tähtäävien sääntelytoimenpiteiden toteuttamisessa. Kansainvälisen kaupan nopean kasvun vuoksi tarkkaan patogeenien tunnistamiseen perustuvat nopeat toimet ovat ratkaisevan tärkeitä suojeltaessa maataloutta ja luonnollisia ekosysteemejä tuhoisilta sairauksilta. Yksi Phytophthora-lajien kanssa työskentelyn haastavimmista puolista on niiden oikea tunnistaminen; se vaatii laajaa koulutusta ja kokemusta. Monet diagnostiset laboratoriot, sekä Yhdysvalloissa että ympäri maailmaa, puuttuvat tämän tyyppisestä koulutuksesta, ja ne tunnistavat usein vain tuntemattomat kulttuurit sukutasolle. Tämä saattaa vahingossa sallia huolta aiheuttavien lajien liukumisen läpi huomaamatta. Lajikompleksit vaikeuttavat lajien molekyylien tunnistamista ja diagnostisten järjestelmien toteuttamista. Lisäksi monia DNA-sekvenssejä väärin tunnistetuista Phytophthora-näytteistä on saatavilla julkisista tietokannoista, kuten NCBI. Tyyppinäytteistä peräisin olevien sekvenssien saaminen on välttämätöntä suvun lajien tarkalle molekyylitunnistukselle.

IDphy kehitettiin helpottamaan suvun lajien tarkkaa ja tehokasta tunnistamista käyttämällä alkuperäisten kuvausten tyyppinäytteitä aina kun mahdollista. IDphy on hyödyllinen tutkijoille ympäri maailmaa, erityisesti diagnostiikka- ja sääntelyohjelmissa työskenteleville. IDphy korostaa lajeja, joilla on suuri taloudellinen vaikutus ja lajeja, jotka ovat tärkeitä Yhdysvalloille.

Tekijät: Z. Gloria Abad, Treena Burgess, John C. Bienapfl, Amanda J. Redford, Michael Coffey ja Leandra Knight

Alkuperäinen lähde: Tämä avain on osa täydellistä IDPhy-työkalua osoitteessa https://idtools.org/id/phytophthora (vaatii Internet-yhteyden). Ulkoiset linkit on annettu tietosivuilla käyttömukavuuden vuoksi, mutta ne edellyttävät myös Internet-yhteyttä. Täydellinen IDphy-verkkosivusto sisältää myös SOP-ohjeita ja strategioita, joilla saavutetaan korkeampi luottamus tuntemattomien lajien molekyylimääritykseen, taulukkoavain; morfologia- ja elinkaarikaaviot sekä kasvu-, varastointi- ja itiöintiprotokollat; ja yksityiskohtainen sanasto.

Tämä Lucid Mobile -avain kehitettiin yhteistyössä USDA APHIS Identification Technology Program -ohjelman (USDA-APHIS-ITP) kanssa. Vieraile osoitteessa https://idtools.org saadaksesi lisätietoja.

Tämän sovelluksen tarjoaa LucidMobile. Vieraile osoitteessa https://www.lucidcentral.org saadaksesi lisätietoja.

Mobiilisovellus päivitetty: elokuussa 2024