IDphy

Přesná identifikace druhů je zásadní nejen pro zvládání onemocnění, ale také pro provádění regulačních opatření k zabránění šíření patogenů. Vzhledem k rychlému nárůstu mezinárodního obchodu jsou rychlé reakce založené na přesné identifikaci patogenů zásadní pro ochranu zemědělství a přírodních ekosystémů před šířením ničivých chorob. Jedním z nejnáročnějších aspektů práce s druhy Phytophthora je jejich správná identifikace; vyžaduje rozsáhlé školení a zkušenosti. Mnoho diagnostických laboratoří, jak v USA, tak po celém světě, postrádá tento typ školení a často pouze identifikuje neznámé kultury na úrovni rodu. To by mohlo nechtěně umožnit druhům, o které se jedná, nepozorovaně proklouznout. Druhové komplexy velmi ztěžují molekulární identifikaci druhů a implementaci diagnostických systémů. Kromě toho je mnoho sekvencí DNA z nesprávně identifikovaných vzorků Phytophthora dostupných ve veřejných databázích, jako je NCBI. Mít sekvence z typových vzorků je zásadní pro přesnou molekulární identifikaci druhů v rodu.

IDphy byl vyvinut, aby usnadnil přesnou a účinnou identifikaci druhů pro tento rod, s použitím typových vzorků z původních popisů, kdykoli je to možné. IDphy je užitečné pro vědce po celém světě, zejména pro ty, kteří pracují v diagnostických a regulačních programech. IDphy klade důraz na druhy s vysokým ekonomickým dopadem a druhy s regulačním zájmem pro USA.

Autoři: Z. Gloria Abad, Treena Burgess, John C. Bienapfl, Amanda J. Redford, Michael Coffey a Leandra Knight

Původní zdroj: Tento klíč je součástí kompletního nástroje IDPhy na https://idtools.org/id/phytophthora (vyžaduje připojení k internetu). Externí odkazy jsou pro usnadnění uvedeny v informačních listech, ale také vyžadují připojení k internetu. Úplné webové stránky IDphy také zahrnují SOP a strategie pro získání vyšší úrovně spolehlivosti v molekulárním určení neznámých druhů, tabulkový klíč; morfologie a diagramy životního cyklu, stejně jako růstové, skladovací a sporulační protokoly; a podrobný glosář.

Tento klíč Lucid Mobile byl vyvinut ve spolupráci s USDA APHIS Identification Technology Program (USDA-APHIS-ITP). Další informace naleznete na adrese https://idtools.org.

Tato aplikace je poháněna společností LucidMobile. Další informace naleznete na adrese https://www.lucidcentral.org.

Aktualizace mobilní aplikace: srpen 2024